牡丹江市直属学校包括以下几所：

1. 长安小学

2. 牡丹江医学院

3. 牡丹江师范学院

4. 牡丹江大学

5. 黑龙江林业职业技术学院

6. 黑龙江农业经济职业学院

7. 黑龙江商业职业学院

8. 黑龙江幼儿师范高等专科学校

这些学校中，牡丹江医科大学和牡丹江师范学院为本科院校，其余为专科院校。

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