根据最新的排名信息，2025年福州最好的医学院是福建医科大学，排名第二的是福建中医药大学。以下是具体排名情况：

1. 福建医科大学

院校类型：医药类

地区：福建福州市

特点：福建省一流大学和一流学科建设高校、福建省重点建设高校、教育部“卓越医生教育培养计划”项目试点高校、中国政府奖学金来华留学生接收院校、国家级大学生创新创业训练计划项目实施高校，福建省卫生人才培养中心、医学科学研究中心和医疗卫生服务中心。

2. 福建中医药大学

院校类型：医药类

地区：福建福州市

请注意，排名信息以学校最新公布的名单为准，如果有变动，建议以最新公布的信息为准