昌吉回族自治州目前有四所本科大学，它们分别是：

新疆师范大学昌吉校区

新疆医科大学昌吉学院

昌吉学院

新疆农业大学昌吉校区

请注意，排名情况可能会因不同的排名机构和评价标准而有所不同，排名并不是衡量大学实力的唯一标准。在选择学校时，考生应该综合考虑自己的需求和兴趣