平潭综合实验区目前有以下几所大学：

1. 福建信息职业技术学院海峡旅游学院和数字创意学院。

2. 福建信息职业技术学院平潭校区。

3. 平潭海峡职业技术学院。

4. 马来西亚博特拉大学中国卫星校区。

5. 正在筹建中的平潭大学和平潭海洋大学。

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