南京硕士毕业生可以申请以下补贴和优惠：

租房补贴

补贴标准：每月800元。

领取条件：

全日制普通高校（含海外留学人员）取得硕士学位。

毕业两年内在我市各类企业、民办非企业、社会团体等单位就业或自主创业，签订1年以上期限劳动合同，缴纳企业职工养老保险。

在南京无自有住房（或与父母共有家庭唯一一套住房）且租房居住。

领取期限：最多连续领取36个月。

购房补贴

补贴标准：根据学位不同，博士生为2000元/月，硕士生为1000元/月。

领取条件：与租房补贴类似，但需注意补贴发放时长为5年，每年核发一次。

其他补贴

学费补贴：每年给予硕士研究生10000元的学费补贴。

生活补贴：每月给予硕士研究生1500元的生活补贴。

科研项目补贴：对于获得国家级和省级科研项目的硕士研究生，分别给予项目经费的10%和5%作为补贴。

落户优惠

研究生及以上学历（含同等学历的留学归国人员、非全日制研究生）可以通过人才落户落户南京。

教育项目

中外合作办学硕士项目，如南京大学与荷兰马斯特里赫特大学合办的国际EMBA硕士项目，以及南京师范大学与美国马里兰大学合作的地信硕士和刑事司法学硕士项目。

以上信息根据最新发布的政策整理得出，具体政策可能会有所变动，建议关注官方最新通知以获得准确信息。