办理大学助学贷款后，费用的扣除方式通常如下：

学校自动扣除

助学贷款申请成功后，贷款机构会将资金发放至学校指定的账户。

学校财务处会根据学生的学费和住宿费情况自动扣除所需费用。

如果贷款金额足以支付学费和住宿费，剩余金额会退回到学生提供的银行账户或支付宝账户。

支付宝账户扣款

贷款发放到学生的支付宝账户后，学校会从该账户中直接扣除学费和住宿费。

如果贷款金额超过所需费用，多余部分会退回到学生的支付宝账户。

提前还款和合同到期还款

学生可以选择提前还款，需在助学贷款系统中申请，并确保账户中有足够的资金以供扣除。

贷款合同到期时，学生需将全部贷款金额还清，由贷款机构同步还款金额至支付宝，再由支付宝进行代扣。

请注意，具体的扣除流程和细节可能因贷款机构和学校政策而异，建议直接咨询贷款机构或学校财务处获取最准确的信息