南京的国家大学包括但不限于以下几所：

南京大学

简称“南大”

教育部直属

“双一流”A类世界一流大学建设高校

“211工程”和“985工程”重点建设高校

东南大学

简称“东大”

教育部直属

“双一流”A类世界一流大学建设高校

“211工程”和“985工程”重点建设高校

南京航空航天大学

简称“南航”

工业和信息化部直属

“双一流”A类世界一流大学建设高校

“211工程”和“985工程”重点建设高校

南京理工大学

简称“南理工”

工业和信息化部直属

“211工程”和“985工程”重点建设高校

河海大学

简称“河海”

教育部直属

教育部、水利部、国家海洋局与江苏省人民政府共建

“211工程”重点建设高校

南京农业大学

简称“南农”

教育部直属

“双一流”A类世界一流大学建设高校

“211工程”和“985工程”重点建设高校

以上信息根据最近更新的数据整理，具体排名和分类可能会有所变动，建议访问相关大学的官方网站或教育部官网获取最新信息