独立本科段和本科段的主要区别体现在以下几个方面：

衔接关系：独立本科段与专科层次起点有衔接关系，它是在专科层次基础上又独立于专科层次的自学考试专业类型，与同专业的专科没有直接的衔接关系。而本科段则是在大学本科的四个年级中，一二年级所学的课程单列成自学考试的相关课程，与其基础科段有直接的衔接关系。

理论考试课程数目：独立本科段的理论考试课程不少于10门，而本科段的理论考试课程则不少于20门。

以上内容仅供参考，具体情况可能因政策、开课情况而有所差异。