合肥科教城拥有众多高等教育机构，其中包括但不限于以下几所大学：

中国科学技术大学- 985、211、双一流建设高校，隶属于中国科学院，以前沿科学与高新技术为主，兼有特色管理和人文学科的综合性全国大学。

合肥工业大学- 教育部直属211院校，双一流建设高校，以工科见长，致力于“工业报国”。

安徽大学- 国家双一流建设高校，安徽省省属211重点综合性大学，始建于1928年，以人文社科和理学为主。

安徽职业技术学院- 提供各类职业技能教育。

合肥铁路工程学校- 专注于铁路工程相关专业教育。

安徽经济技术学院- 侧重于经济和技术领域的教育。

安徽涉外经济学院- 专注于涉外经济类专业教育。

安徽广播影视职业技术学院- 专注于广播影视类专业教育。

合肥幼儿师范学校- 培养幼儿教育人才。

安徽新华学院- 提供多样化高等教育。

安徽城市管理职业学院- 专注于城市管理领域职业教育。

此外，合肥科教城还包括合肥联合大学、合肥市第五十中学、合肥西园小学等教育机构，以及中科院合肥分院等科研机构。

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