二本和三本院校的主要区别在于：

录取批次

二本院校通常在高考招生中属于第二批次录取。

三本院校一般在第三批次录取。

高校性质

二本院校主要是省属本科院校和普通公办本科院校。

三本院校通常包括独立学院和民办本科院校。

学费

二本院校的学费相对较低。

三本院校的学费相对较高。

社会认可度

二本院校由于是公办高校，社会认可度较高。

三本院校由于以民办性质为主，社会认可度相对较低。

教育资源

二本院校通常可以获得更多的财政资助，享有更好的教育资源。

三本院校由于不能获得财政资助，其教育资源相对有限。

毕业证书

无论是二本还是三本，毕业证书和学位证书都是相同的，不标明是几本，只表明是本科。

需要注意的是，不同省份对于一本、二本、三本的划分可能会有所不同，且近年来一些省份已经取消了三本批次，三本院校可能已经转变为独立学院。