根据最新的排名信息，上海市大学排名100强中，前三位的高校分别是：

1. 复旦大学

2. 上海交通大学

3. 同济大学

这三所大学均属于985、211工程，并且是双一流大学建设之世界一流大学建设A类高校。

其他进入排名前列的高校还包括：

华东师范大学

上海财经大学

上海科技大学

上海外国语大学

东华大学

海军军医大学

上海大学

华东理工大学

请注意，排名可能会随着时间和不同评价机构的标准有所变化，以上信息以最新发布的排名为准。