菏泽学院最好专业的排名如下：

环境科学与工程- 中国一流应用型专业

机械电子工程- 中国一流应用型专业

能源化学工程- 中国高水平应用型专业

制药工程- 中国高水平应用型专业

生物技术- 中国高水平应用型专业

生物工程- 中国高水平应用型专业

以上排名根据2023年校友会发布的数据，这些专业在菏泽学院中具有较高的办学层次和星级排名，可以认为是菏泽学院的优势专业。

请注意，排名可能会随着时间和不同评价机构的标准有所变化，请以最新公布的信息为准。如果您需要了解更多详细信息，请告诉我