自学日语本科课程通常包括以下几门主要课程：

1. 中国近现代史纲要

2. 马克思主义基本原理概论

3. 第二外语（俄语、法语、德语、英语等）

4. 高级日语（一）、（二）

5. 日语语法

6. 日本文学选读

7. 日语笔译

8. 古代汉语

9. 日语写作

10. 日语听译

11. 日语（本科）毕业论文

12. 中级日语（二）

13. 日语听力

这些课程涵盖了日语语言学习、日本文化、文学、翻译理论等方面。