根据提供的信息，2006年重庆的大学排名如下：

1. 重庆大学

2. 西南大学

3. 中国人民解放军陆军军医大学

4. 西南政法大学

5. 重庆医科大学

6. 重庆邮电大学

7. 重庆交通大学

8. 重庆师范大学

9. 重庆工商大学

10. 重庆理工大学

11. 重庆科技学院

12. 重庆文理学院

13. 长江师范学院

请注意，这个排名信息是基于2006年的数据，可能与当前情况有所不同。如果您需要最新的大学排名信息，建议查询相关官方发布的最新排名数据