上海地区在理科二本批次招生的大学包括：

1. 上海海关学院

2. 上海海事大学

3. 上海海洋大学

4. 上海工程技术大学

5. 上海理工大学

6. 上海师范大学

7. 上海立信会计学院

8. 上海商学院

9. 上海应用技术学院

10. 上海政法学院

以上是根据最近的信息整理的排名情况，具体排名可能会根据每年的高考成绩和招生计划有所变动。如果您需要最新的排名信息，请参考官方最新发布的数据