太仓中集和南通中集在某些方面存在一些差异，具体如下：

1. 质量检测：太仓中集有严格的质量检测部门，确保所有产品的质量符合相关标准，而南通中集的产品质量则不太稳定，同一批次的产品可能存在较大的差异。

2. 自主设计建造：南通中集能够自主设计建造，具有安全、节能和环保等特点。

综上所述，太仓中集在质量检测方面较为严格，而南通中集在自主设计建造方面具有优势。