两年制研究生和三年制研究生在培养方向、学制、招生条件等方面存在不同。

1.培养方向：

两年制研究生主要是为特定的行业培养优秀的实践型人才，例如医学、工程、管理等领域。而三年制研究生则主要是培养理论性人才，注重培养学生的教学和科研能力，例如哲学、经济学、法学等领域。

2.学制：

两年制研究生学制为两年，通常学生在大学阶段完成两年学业后，即可毕业并开始工作。

3.招生条件：

两年制研究生要求报考学生必须有一定的工作经验，并且报考人员需要征得所在单位的同意，否则不能报考。而三年制研究生则没有这些要求。