西南科技大学前身有农学专业，前身为原遂宁农校1939年开设的“农学专业”，办学历史悠久。

2001年设置农学本科专业并开始招生，2006年被评为“西南科技大学优秀本科专业”。

2008年获批“四川省特色专业建设点”，2009年获批“国家特色专业建设点”、2013年获批“国家级大学生实践基地”，2014年获批“四川省实用技能型卓越农林人才培养试点专业”。

2019年获批“四川省一流专业建设点”，2021年获批“国家一流专业建设点”，2015年获批农业硕士专业学位，并开始招生。