启东市内的大学包括：

南通大学启东校区

办学层次以本科为主，杏林学院设有43个专业。

环境优美，设施齐全，包括教学楼、实验楼、图书馆、体育馆、宿舍楼等。

启东开放大学

属于江苏开放大学办学系统，提供本专科学历教育和职业能力培训。

启东理工学院

一所全日制普通本科院校，专业涵盖工学、管理学、经济学等领域。

注重实践教学，与多家企业合作，提供实习和就业机会。

上海工程技术大学启东产业技术研究院暨国家大学科技园启东园区

虽然不是传统意义上的大学，但作为研究机构与科技园，对启东市的产业发展具有推动作用。

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