日本最冷门的大学可能因不同的评价标准和时间而有所变化，但以下是一些可能被认为相对冷门但具有特色的日本大学：

芝浦工业大学

口碑良好，但国内知名度不高。

理科，特别是数理物质科学研究科是优势学科。

一桥大学

纯文科类院校，在日本大学排名中位于前20位。

商科专业不输给早稻田大学。

筑波大学

位于东京东北部的茨城县筑波市，被誉为日本的“硅谷”。

理科，尤其是数理物质科学研究科是优势学科。

金泽大学

日本“旧六医科大学”之一，代表日本医学教育的最高水平。

医药学域及癌症研究所在世界抗癌研究领域首屈一指。

熊本大学

日本最美丽及历史最为悠久的校园之一。

诞生了2位日本首相，其他专业领域也表现出色。

津田塾大学

著名私立女子大学，拥有两个校区，位于东京都。

在世界大学排名日本版中连续5年获得第一名。

这些大学可能在某些领域或方面具有独特的优势，但在整体知名度上可能不如东京大学、京都大学等名校。如果你对某一特定领域或学校感兴趣，可以进一步了解相关信息。