三亚崖州湾大学城目前入驻的知名大学包括：

1. 海南大学：综合性大学，覆盖多个学科门类。

2. 三亚学院：全日制普通本科院校，以应用型学科为主。

3. 海南热带海洋学院：以热带海洋学科为特色。

4. 海南医学院：以医学教育和研究为主。

5. 三亚航空旅游职业学院：以航空旅游专业为主。

此外，海南省政府已经与上海交通大学、中国农业大学、中国海洋大学、北京外国语大学、北京语言大学、中国传媒大学、武汉理工大学、中央民族大学等8所高校签订了省校合作协议，预示着未来可能会有更多的教育和科研机构入驻。