南京交通大学的就业前景是良好的。根据提供的信息，南京交通大学与多家知名企业建立了紧密的合作关系，为学生提供了广阔的就业渠道。毕业生就业率始终保持在96%以上，并且就业质量在不断提高。主要就业单位包括南京地铁、江苏交通控股有限公司、江苏汽车集团有限公司等大型企业，学生就业满意度较高。

此外，虽然交通工程专业的本科毕业生可能在就业市场上遇到一定的竞争，因为许多工作技能与土木工程专业重叠，但南京交通大学通过其合作关系和专业知识培养，为学生提供了较好的就业机会。