根据提供的信息，2024年新疆最难考的大学排名如下：

1. 清华大学

2. 北京大学

3. 复旦大学

这些排名是根据新疆地区考研难度来确定的，其中新疆大学、石河子大学和新疆医科大学等高校也位于排名前列，表明这些院校的考研难度较大。

请注意，考研难度排名可能会根据当年的报考人数、招生名额等因素有所变化，建议结合个人实际情况和目标院校的最新招生信息进行报考决策