根据提供的信息，以下是2025年日本最好的医学院排名：

1. 东京大学医学部

2. 京都大学医学部

3. 大阪大学医学部

4. 东北大学医学部

5. 名古屋大学医学部

6. 九州大学医学部

7. 庆应义塾大学医学部（私立）

8. 东京医科齿科大学医学部

9. 奈良医科大学医学部

10. 千叶大学医学部

这些排名基于不同的评价标准，包括教育质量、研究实力、入学难度等因素。东京大学的医学部通常被认为是中国留学生求学的首选，因为它的高标准和严格的淘汰率保证了其亚洲领先的地位。京都大学和大阪大学也是医学教育与研究实力非常强的学府。