南京药科大学药学专业考研的科目通常包括：

1. 思想政治理论（满分100分）

2. 考研英语（满分100分）

3. 药学基础综合（一）（满分300分）

药学基础综合（一）通常涵盖以下科目：

药物化学

药剂学

药物分析学

药理学

药事法规

具体的参考书目可能包括《药物化学》，叶发青、李飞主编，第一版，华中科技大学出版社（2019年）等。

请注意，以上信息基于历史数据和以往的考研情况，具体科目和考试内容可能会有变动，建议直接咨询南京药科大学或查看最新的招生简章获取最准确的信息