南京的三本院校包括但不限于以下几所：

1. 东南大学成贤学院

2. 南京邮电大学通达学院

3. 南京师范大学中北学院

4. 南京航空航天大学金城学院

5. 中国传媒大学南广学院

6. 金陵科技学院龙蟠学院

7. 南京医科大学康达学院

8. 南京理工大学紫金学院

9. 南京审计大学金审学院

10. 南京中医药大学翰林学院

11. 南京艺术学院

12. 南京财经大学红山学院

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