南京市拥有众多知名的高等院校，以下是部分排名情况：

南京大学

985工程

211工程

双一流

全国排名：第5名

东南大学

985工程

211工程

双一流

全国排名：第22名

南京航空航天大学

211工程

双一流

全国排名：第36名

南京理工大学

211工程

全国排名：第40名

河海大学

双一流

全国排名：第39名

南京师范大学

全国排名：第6名

南京农业大学

双一流

全国排名：第39名

中国药科大学

全国排名：未提及

南京邮电大学

全国排名：未提及

南京信息工程大学

全国排名：未提及

请注意，以上排名可能会有所变动，请以教育部门公布的最新权威信息为准。