专用工具在会计核算中应根据其价值的高低和用途，在固定资产或低值易耗品科目中进行核算。如果专用工具的价值较高，并且满足固定资产的条件，则应计入固定资产核算。如果专用工具的价值较低，或者是一次性消耗的，则可以将其直接计入费用科目。

1. 如果专用工具价值较大，符合固定资产条件，会计分录可能如下：

借：固定资产

应交税费-应交增值税-进项税

贷：银行存款/应付账款

2. 如果专用工具价值较低，或是一次性消耗，会计分录可能如下：

借：销售费用/管理费用/制造费用

贷：银行存款/应付账款

请根据具体情况选择合适的会计科目进行核算