当前安徽最好的两所大学排名如下：

中国科学技术大学

综合指数：85.9

排名情况：全国排名第7名

特点：985工程、211工程，是中国顶尖的理工类高校之一，在量子物理、计算机科学、材料科学等领域具有世界领先的科研实力。

合肥工业大学

综合指数：84.3

排名情况：全国排名第54位

特点：工科为主，机械工程、电子信息、自动化等领域有较强的科研和教学能力，是“中国一流大学”。

这两所大学在各自的领域都有很高的学术地位和影响力，是中国高等教育的重要组成部分