南京邮电大学的王牌专业主要包括计算机科学、物理学、材料科学等学科，这些学科在ESI（Essential Science Indicators）排名中位于全球前百分之一的位置。此外，通信工程、电子信息工程、网络工程、计算机科学与技术、电磁场与无线技术、测控技术与仪器、自动化、信息安全、光电信息工程、地理信息系统专业也是南京邮电大学的优势专业。

国家特色专业建设点：通信工程、电子信息工程、电子科学与技术、计算机科学与技术、信息安全、自动化、工商管理。

省级品牌特色专业及建设点：通信工程、电子信息工程、电子信息科学与技术、电子科学与技术、光信息科学与技术、计算机科学与技术、自动化、测控技术与仪器、信息与计算科学、工商管理、信息管理与信息系统、英语等。

重点专业名单：通信工程、电子信息工程、信息安全、电子科学与技术、工商管理、计算机科学与技术、自动化。

这些专业在学术声誉、师资力量、就业前景等方面都具有较高水平，是南京邮电大学的王牌专业