会泽县拥有的重点大学包括云南大学会泽院。云南大学会泽院位于云南大学东陆校区，是一处历史悠久的文物建筑群，由会泽院、《会泽唐公创办东陆大学记》铜碑、九十五级台阶及西式喷水池组成。

此外，会泽县近年来在高等教育方面也取得了显著成绩，例如在2023年有15名学生被清华大学和北京大学录取，其中清华大学7人，北京大学8人。会泽籍在清华、北大就读的学生总数将达到61人。

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