云南中医药大学的专业设置包括：

1. 中医学

2. 针灸推拿学

3. 中医儿科学

4. 中西医临床医学

5. 中医骨伤科学

6. 中医养生学

7. 中医康复学

8. 康复治疗学

9. 中药学

10. 药学

11. 制药工程

12. 药物制剂

13. 食品质量与安全

14. 中药资源与开发

15. 护理学

16. 公共事业管理

17. 傣医学

这些专业涵盖了中医药领域的多个方面，旨在培养能够在医疗、教育、科研等领域工作的专业人才。