阿荣旗那吉镇的教育机构包括：

1. 小学：

第一小学

第二小学

第三小学

第四小学

2. 初中：

第二中学

第三中学（学生较少，主要为乡镇学生）

第四中学

阿荣旗那吉屯第四中学

3. 高中：

那吉屯一中

4. 中专：

阿荣旗职业中专

5. 其他教育机构：

呼伦贝尔开放大学阿荣旗那吉镇社区学校

呼伦贝尔岭东特殊教育学校

呼和浩特市旺旺艺术学校（位于呼和浩特市，非那吉镇）

呼伦贝尔学院继续教育学院（提供函授教育）

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