綦江区拥有以下大学：

重庆外语外事学院綦江校区：

这是一所全日制民办普通本科高等学校，前身是四川外语学院重庆南方翻译学院，后更名为重庆外语外事学院。

重庆移通学院綦江校区：

重庆移通学院的一个分校区，提供全日制普通本科教育。

重庆理工大学（花溪校区）：

溯源于1940年，是一所重点建设的多科性大学。

重庆交通大学（科学城校区）：

由重庆市人民政府和交通运输部共建，是一所具有交通特色的大学。

此外，綦江区还引进了其他教育机构，如重庆电讯职业学院、重庆德国埃森大学、重庆健康工程职业学院和重庆电影职业学院等。

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