京都大学拥有丰富的博士专业设置，涵盖了广泛的学术领域。以下是一些主要的博士专业：

研究生院设置

文学研究科

文献文化学

思想文化学

历史文化学

行动文化学

现代文化学

教育学研究科

教育科学

临床教育学

法学研究科

基础法学

公法

民刑事法

政治学

经济学研究科

经济系统分析

经济动态分析

组织经营分析

现代经济学

亚洲･非洲地域研究研究科（5年制直博）

东南亚地域研究

非洲地域研究

全球地域研究

情报学研究科

智能情报学

社会情报学

先端数理科学

数理工学

系统科学

通信情报系统

理学研究科

数学･数理解析

物理学･宇宙物理学

地球惑星科学

化学

生物科学

工学研究科

土木工学

土木系统工学

资源工学

环境工学

环境地球工学

建筑学

生活空

学部设置

综合人类学部

人间科学系

国际文明学系

文化环境学系

认知情报学系

自然科学系

文学部

人文学科：哲学基础文化学系、东洋文化学系、西洋文化学系、历史基础文化学系、行动･环境文化学系、基础现代文化学系

教育学部

教育科学科：现代教育基础学系、教育心理学系、相关教育系统论系

法学部

基础法学系

公法学系

民刑事法学系

政治学系

经济学部

经济学科

经营学科

理学部

理学科：数学系、物理学･宇宙物理学系、地球行星科学系、化学系、生物科学系

医学部

（未提供详细信息）

药学部

（未提供详细信息）

工学部

地球工学科

建筑学科

物理工学科

情报学科

电气电子工学科

工业化学科

农学部

（未提供详细信息）

以上信息基于京都大学官方网站提供的最新数据。请注意，随着时间的推移，专业设置可能会有所调整，建议直接访问京都大学官方网站或联系学校相关部门获取最新信息