石河子卫生学校开设的专业主要包括：

1. 护理学

中专和大专两种教育层次

大专为石河子大学在该校委培专业，颁发石河子大学的毕业证书

学制：三年（汉语），四年（民语言）-预科一年

2. 药剂学

3. 医学检验技术

4. 康复技术

5. 助产护理

6. 英语护理

7. 社区护理

8. 中药

9. 解剖、生理、生化、药理、化学、微生物、计算机、远程、电教中心等实验室相关专业

学校提供全日制教育，并实行“1+X”双证书毕业制度，以提高学生的市场竞争能力。学校还设有“新疆生产建设兵团第五十三国家职业技能鉴定所”和“石河子卫生行业技能培训中心”，具备多种职业工种的认定资格。