北京著名的医科大学包括：

北京协和医学院- 与中国医学科学院实行院校合一的管理体制，是国家卫生健康委员会直属的全国重点大学，也是“双一流”建设高校。

北京大学医学部- 前身为国立北京医学专门学校，是中国政府依靠自己的力量开办的第一所专门传授西方医学的国立学校，是国家“211工程”和“985工程”首批建设的高等学校。

北京中医药大学- 以中医药学为主干学科的全国重点大学，直属教育部管理，是国家“211工程”和“985工程”重点建设大学。

首都医科大学- 原名北京第二医学院，后更名为首都医科大学，是北京市重点院校之一。

这些学校都是医学领域内享有盛誉的教育和研究机构，提供本科、研究生等多层次的教育，并在医学教育和研究领域具有显著的影响力。