重庆医药高等专科学校的热门专业排名如下：

1. 口腔医学（大学城校区）

2. 康复治疗技术（陆军校区，只招女生）

3. 医学影像技术（大学城校区）

4. 助产（大学城校区）

5. 护理专业

6. 药品生产技术专业

7. 药学

8. 药品质量与安全

9. 中药学

10. 临床医学

11. 中医学

12. 针灸推拿

13. 预防医学

请注意，排名可能会根据学校最新的政策和公布信息有所变动，建议以学校官方最新公布的信息为准