中国最好的大学在不同评价标准和数据下有所差异，以下是一些在不同排名中表现突出的大学：

北京市

北京大学：国内顶尖高校，综合性强，学科全面。

清华大学：国内顶尖高校，理工科尤为突出。

中国人民大学：人文社科类强校，国内一流。

北京师范大学：师范类高校，教育学科全国领先。

上海市

复旦大学：国内顶尖高校，综合性强。

上海交通大学：国内顶尖高校，理工科和医学尤为突出。

同济大学：国内顶尖高校，工科和建筑学强。

南京市

南京大学：国内顶尖高校，综合性强。

东南大学：国内一流高校，工科和理科突出。

武汉市

武汉大学：国内顶尖高校，综合性强，学科全面。