福建船政交通职业学院的王牌专业包括：

1. 航海技术

2. 轮机工程技术

3. 安全技术与管理

4. 汽车检测与维修技术

5. 道路桥梁工程技术

6. 机电一体化技术

7. 物流管理

8. 计算机应用技术

9. 报关与国际货运

这些专业因其高质量的教育资源和实践机会，以及强大的师资力量，被认为是学院中最好的专业。请注意，专业排名可能会随着时间和学校政策的变化而有所调整，建议以学校最新公布的信息为准