常熟东南开发区内的教育机构包括：

常熟理工学院东南校区

包含多个学院，如工学院、商学院、信息学院、艺术与设计学院、外国语学院、文学与传媒学院、体育学院、继续教育学院等。

提供工程技术、商务管理、信息科学、艺术设计、外语教育、文学传媒、体育教育等领域的教育。

设有实验中心、图书馆、科研机构等，为学生提供良好的学习和科研条件。

常熟职业技术教育学院

国家级重点职业学校，由常熟市政府投资建立。

包含机电、电子、信息、经贸等部系，提供职业培训。

中学

常熟一中（重点中学）

常熟二中

常熟三中

常熟四中

常熟五中

其中，常熟一中是重点学校，其他四所中学也都有良好的教育质量和努力方向。