中国民用航空飞行学院在飞行技术、无人驾驶航空器系统工程、导航工程这三个专业方面表现突出。根据最近的信息，这三个专业在全国的排名情况如下：

1. 飞行技术专业

2023年排名前三的大学院校分别是：

第一名：南京航空航天大学

第二名：中国民用航空飞行学院

第三名：中国民航大学

2. 无人驾驶航空器系统工程

该专业在2023年的排名中并未提及，但根据中国民用航空飞行学院在该领域的强势，可以推测其在该专业中也有很高的排名。

3. 导航工程专业

该专业在2023年的排名中同样并未提及，但考虑到中国民用航空飞行学院在航空领域的整体实力，可以预计该专业也有很好的排名。

以上排名基于最近的数据更新，具体情况可能会有所变动。如果您需要最新的排名信息，建议查询相关官方渠道或教育评估网站