当前船舶专业博士排名前三的学校如下：

哈尔滨工程大学

学科评估结果：A+

特点：源自1953年创办的中国人民解放军军事工程学院（哈军工），是首批具有博士、硕士学位授予权的单位，拥有“三海一核”办学方略。

上海交通大学

学科评估结果：A+

特点：中国历史悠久、国际知名的综合性、创新型、国际化大学，拥有52个一级学科博士学位授权点。

海军工程大学

学科评估结果：B+

特点：前身是1949年建立的大连海军学校机械系，以本科教育与研究生教育为主体，学历教育与任职培训相结合。

以上排名基于第四轮船舶与海洋工程学科评估结果，该评估按照“自愿申请、免费参评”的原则，采用“客观评价与主观评价相结合”的方式进行。