东南大学环境工程考研的科目主要包括：

1. 公共基础课程：

高等数学

线性代数

概率论与数理统计

工程数学

工程力学

材料力学

工程热力学

2. 专业基础课程：

环境化学

环境微生物学

环境监测与分析

环境生态学

环境工程原理

环境工程实验

3. 专业选修课程：

污染控制工程

环境风险评估

环境影响评价

环境统计学

环境法律法规

4. 初试科目（以2024年信息为准）：

101思想政治理论

201英语（一）

302数学（二）

927普通化学或922工程流体力学

5. 复试笔试科目可能包括：

水污染控制

大气污染控制

请根据最新的招生简章或咨询学院了解具体的考试科目和参考书目