在安徽省阜阳市，有两所本科院校，分别是：

阜阳师范学院

主管部门：安徽省教育厅

所在地：阜阳市颍州区

办学层次：本科

备注：公办，安徽省属普通高等学校，入选第一批卓越农林人才教育培养计划改革试点项目。

阜阳理工学院

主管部门：安徽省教育厅

所在地：阜阳市颍州区

办学层次：本科

备注：民办，由阜阳市国有企业全资举办的全日制民办普通本科高校。

以上信息根据最新的教育部公布的高校名单整理得出。