生物光学研究员的工作通常包括以下几个方面：

确定研究方向和目标

根据实际需求和应用背景，明确研究的具体方向。

设定明确的研究目标。

文献调研和理论分析

查阅相关学术文献、专利、技术报告等资料。

运用理论知识进行问题分析，为实验设计和仿真提供理论支持。

实验设计和实施

设计合理的实验方案，包括实验目的、原理、装置、步骤和数据处理方法。

严格控制实验条件，确保实验结果的准确性和可靠性。

记录实验数据和现象，为数据分析提供基础。

仿真模拟和数据分析

使用计算机模拟软件（如Zemax、MATLAB等）模拟光学现象。

根据实验数据和理论模型设置参数和边界条件。

对实验数据进行详细分析，提取有用信息。

参与项目申报

协助中心教授完成项目书面材料的撰写、收集与整理。

实验室管理和安全工作

负责实验室的日常管理和确保实验安全。

辅导助理研究员及博士生

协助指导初级研究人员的工作。

生物光学研究员的具体职责和薪资可能因机构和地区而异，具体薪资需要面议。