日本在职读研的专业排名如下：

机械工程

优势院校：东京大学、东京工业大学、东北大学、名古屋大学、筑波大学、九州大学、北海道大学等。

计算机互联网

优势院校：京都大学、东京工业大学、东北大学、九州大学、名古屋大学、大阪大学等。

机器人科学

优势院校：东京大学、东京工业大学、大阪大学、东北大学、名古屋大学、筑波大学、九州大学、北海道大学等。

工程专业

优势院校：东京大学、京都大学、东北大学、九州大学、北海道大学、广岛大学、千叶大学等。

动漫专业

优势院校：东京艺术大学、武藏野美术大学、多摩美术大学、东京工艺大学、京都精华大学、东京造型大学、京都造型艺术大学、大阪艺术大学等。

传媒及新闻相关专业

优势院校：京都大学、北海道大学、筑波大学、大阪大学、早稻田大学、庆应义塾大学、上智大学、同志社大学等。

以上排名基于最近的信息，具体排名可能会根据不同的评价标准和时间有所变化。建议在选择专业和学校时，还需考虑个人的兴趣、职业规划以及语言能力等因素。