合肥的二本学校包括：

1. 安徽建筑工业学院

2. 合肥学院

3. 合肥师范学院

4. 安徽医科大学（部分专业招一本）

5. 安徽中医学院（部分专业招一本）

6. 安徽农业大学（省内招一本，省外招二本）

7. 安徽工程大学

8. 安徽科技学院

9. 巢湖学院

10. 安徽三联学院

11. 安徽新华学院

12. 安徽文达信息工程学院

13. 安徽外国语学院

14. 安徽工业大学（以工科见长，部分专业可能招一本）

15. 安徽理工大学（以医学和工程技术为主，注重实践教学）

请注意，以上信息以教育部门公布的最新权威信息为准，具体招生情况可能会有变动，建议直接咨询相关学校或教育部门获取最新信息