药学硕士最好的大学排名如下：

北京协和医学院

中国药科大学

北京大学

沈阳药科大学

浙江大学

这些排名综合了不同年份的评估结果，因此建议考生和家长综合考虑各学校的学科实力、师资力量、教学设施以及就业情况等因素，选择最适合自己的学校。