学校档案可能存在的问题主要包括：

档案保管安全问题

个人隐私泄露风险。

保密制度不完善。

数据丢失及损毁问题

纸质档案易受环境影响损坏。

电子档案管理系统不稳定。

管理不规范问题

档案收集、整理、录入不规范。

档案归类和立卷工作不规范。

档案存放不合理，保护措施不当。

资源短缺问题

经费和物资不足。

缺乏信息化技术支持。

其他问题

档案室建设“硬件”投入不足。

档案库房条件差，设备陈旧。

档案管理人员素质参差不齐，缺乏专业知识。

档案转递程序不规范，如未严格按照机要局规定转递人事档案。

这些问题可能会影响档案的安全、完整性和可用性，进而影响学校的管理和决策。